Neonatalna sekcija je strokovno združenje zdravnikov, ki delujejo na področju neonatologije in oskrbe novorojenčkov v slovenskih porodnišnicah, bolnišničnih enotah ter oddelkih za neonatalno intenzivno nego in terapijo. 

Deluje kot sekcija Združenja za pediatrijo Slovenskega zdravniškega društva in s svojim delovanjem povezuje ključne strokovnjake ter ustanove na področju neonatalne medicine v Sloveniji. 

Njeno poslanstvo je izboljševanje kakovosti oskrbe in zdravljenja novorojenčkov z razvojem in uveljavljanjem visokih standardov preventivnih ukrepov, diagnostike, zdravljenja in zgodnje rehabilitacije. Sekcija to uresničuje z organizacijo strokovnega izobraževanja, spodbujanjem raziskovalnega dela, spremljanjem kakovosti strokovne obravnave ter pripravo strokovnih usmeritev za posamezna področja neonatologije.